Возможность Заказчика удержать 10% от цены контракта за нарушения Подрядчика при выполнении работ по ремонту кровли здания

Ситуация следующая: В рамках тендерного Договора подряда, Подрядчик в процессе выполнения работ по ремонту кровли здания несколько раз допускал затопления помещений. В каждом случае, Заказчик составлял соответствующие акты с требованием устранить последствия затопления указанных помещений. Подрядчик в свою очередь, исполнял свои обязательства по устранению последствий затопления помещений надлежащим образом, сделав косметический ремонт таких помещений в каждом отдельном случае. После принятия Заказчиком отремонтирванных помещений после затоплений, стороны составляли соответствующие акты о том, что сторона Заказчика приняла указанные работы и претензий к Подрядчику не имеет.

В договоре прописано такое условие: За каждый факт неисполнения или ненадлежащего исполнения Подрядчиком обязательств, предусмотренных Контрактом, за исключением просрочки исполнения обязательств (в том числе гарантийного обязательства), предусмотренных Контрактом, размер штрафа устанавливается в следующем порядке: а) 10 процентов цены Контракта в случае, если цена Контракта не превышает 3 млн. рублей...

Собственно вопрос! Может ли Заказчик воспользоваться вышеуказанным условием и удержать при окончательном расчете с Подрядчика 10 процентов от цены контракта за каждый факт допущенных нарушений со стороны Подрядчика, с учетом того, что Подрядчик в каждом случае допущенных нарушений устранял последствия таких нарушений?