Как подать ходатайство на отвод эксперта в гражданском деле?

Если она уже назначена практически ни как.

Ждать заключение и его изучать, что там не правильно.

В силу пункта 1 статьи 18 ГПК РФ, основания для отвода судьи, указанные в статье 16 настоящего Кодекса, распространяются также на прокурора, помощника судьи, секретаря судебного заседания, эксперта, специалиста, переводчика. Это значит, что эксперт подлежит отводу, если он:

1) при предыдущем рассмотрении данного дела участвовал в нем в качестве прокурора, помощника судьи, секретаря судебного заседания, представителя, свидетеля, эксперта, специалиста, переводчика;

1.1) являлся судебным примирителем по данному делу;

2) является родственником или свойственником кого-либо из лиц, участвующих в деле, либо их представителей;

3) лично, прямо или косвенно заинтересован в исходе дела либо имеются иные обстоятельства, вызывающие сомнение в его объективности и беспристрастности.

Эксперт, кроме того, не может участвовать в рассмотрении дела, если он находился либо находится в служебной или иной зависимости от кого-либо из лиц, участвующих в деле, их представителей.

По идее, Вам необходимо было заявлять мотивированный отвод сразу, при оглашении определения судебной коллегии о назначении экспертизы. Боюсь, что на данный момент Вы уже опоздали с отводом. Теперь единственное, что можно сделать - ознакомиться с заключением экспертов и при несогласии с заключением представить мотивированное ходатайство о назначении дополнительной/повторной судебной экспертизы (в зависимости от конкретных обстоятельств). Такие дела.