Как оформить декларацию о доходах, если все документы на машину находятся у супруги отца?

Вам необходимо подать в налоговую декларацию в связи с продажей автомобиля, регистрация автомобиля на другого долевого собственника в органах ГИБДД не освобождает вас от обязанностей, в налоговой вас проконсультировали правильно.

Ваше имущество продана, а значит получили доход.

Его и нужно указать в декларации.

Да, при продаже автомобиля, а для вас полученной доли от его продажи, вы должны заполнить налоговую декларацию 3-НДФЛ и подать ее в налоговый орган по месту жительства. Если автомобиль находился во владении более трех лет форма в данном случае не требуется, так как владелец автомобиля освобождается от уплаты налога.

К сведению: "Налоговый кодекс Российской Федерации (часть вторая)" от 05.08.2000 N 117-ФЗ (ред. от 26.03.2022) (с изм. и доп., вступ. В силу с 26.04.2022)

Статья 229. Налоговая декларация

1. Налоговая декларация представляется налогоплательщиками, указанными в …и пункте 1 статьи 228 настоящего Кодекса.

2. Лица, на которых не возложена обязанность представлять налоговую декларацию, вправе представить такую декларацию в налоговый орган по месту жительства.

Статья 217. Доходы, не подлежащие налогообложению (освобождаемые от налогообложения)

17.1) доходы, … от продажи иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика три года и более.