И как подавать исковое заявление с копиями правильно - все вместе или сделать три отдельных комплекта по папкам?

В соответствии со ст. 132 ГПК РФ, К исковому заявлению прилагаются:

его копии в соответствии с количеством ответчиков и третьих лиц;

документ, подтверждающий уплату государственной пошлины;

доверенность или иной документ, удостоверяющие полномочия представителя истца;

документы, подтверждающие обстоятельства, на которых истец основывает свои требования, копии этих документов для ответчиков и третьих лиц, если копии у них отсутствуют;

текст опубликованного нормативного правового акта в случае его оспаривания;

доказательство, подтверждающее выполнение обязательного досудебного порядка урегулирования спора, если такой порядок предусмотрен федеральным законом или договором;

расчет взыскиваемой или оспариваемой денежной суммы, подписанный истцом, его представителем, с копиями в соответствии с количеством ответчиков и третьих лиц.

В самом тексте искового заявления, Вы вправе указать на конкретные нормы права (статьи Законов), которые нарушены, либо создана угроза для их нарушения.

Официально нигде не закреплено, но Вы вправе указать в иске конкретное решение вышестоящего суда (судов) по аналогичным делам, в качестве правового обоснования Вашей позиции.

Если Вас не устраивает ответ, а он дан в соответствии с Вашим вопросом и соответствует требованиям ГПК РФ, и при этом Вы хотите сэкономить на расходах по оплате юридической помощи, оптимальным вариантом будет поступление на юридический факультет и всего через 5 лет Вы сами узнаете "правильный ответ" на свой вопрос.

Удачи Вам.