После командировки у меня потребовали счёт-фактуру из гостиницы, где я останавливался как физическое лицо.

Добрый вечер Святослав.

Для подтверждения Ваших расходов перед бухгалтерией, вполне достаточно представленных вами документов, однако для того, что бы вашей бухгалтерии произвести вычет НДС (который должен содержаться в сумме оказанных вам услуг) им необходима счет-фактура.

Согласно п.1 ст.172 Налогового кодекса Российской Федерации (далее - Кодекс) и п.10 Постановления Правительства Российской Федерации от 02.12.2000 N 914 "Об утверждении Правил ведения журналов учета полученных и выставленных счетов-фактур, книг покупок и книг продаж при расчетах по налогу на добавленную стоимость" (с изм. и доп.) суммы налога на добавленную стоимость, уплаченные по расходам на командировки, в том числе по услугам гостиниц, принимаются к вычету либо на основании счетов-фактур, выставленных гостиницами при оказании данных услуг, и документов, подтверждающих фактическую уплату налога, либо на основании документов строгой отчетности.

Таким образом, основанием для вычета налога на добавленную стоимость, уплаченного за услуги гостиниц, являются счет-фактура и документы, подтверждающие фактическую уплату налога (кассовый чек с выделенной в нем суммой налога отдельной строкой, либо бланк строгой отчетности, в котором указана сумма налога).

Что касается счетов-фактур, то согласно п.3 ст.169 Кодекса обязанность составлять счета-фактуры, вести журналы учета полученных и выставленных счетов-фактур, книги покупок и книги продаж возложена на плательщиков налога на добавленную стоимость (т.е. на гостиницу, если она не на упрощенной системе налогообложения).

Поэтому при оказании услуг гостиницами счета-фактуры должны выставляться организациям, командирующим своих сотрудников.

Вполне возможно, созвониться с гостиницей и попросить выслать счет-фактуру по почте (предварительно сообщив все необходимы реквизиты вашей организации)