Органы проверки подтверждают нарушения, но иск о неоплате труда отклонен - как защитить свои права?

У меня трудовой спор с работодателем, который длится с июля 2015 г (неоплата ученического отпуска). Я подавала жалобу в ТИ, была проверка, я получила ответ что якобы я не предоставила необходимые документы для оплаты. 9 го сентября я передала документы в отдел кадров с отметкой о входящей документации, но 30 сентября в аванс денег так и не получила, как и 15.10 в день выплаты зп. Обратилась повторно в ТИ и прокуратуру. Прокуратура выявила нарушение, было постаноаление, штраф. На всякий случай я подала в суд иск. На судебное заседание приехала из другого города, т.к. к этому времени переехала и работаю в другом месте. В ходе судебного заседания пришли к тому, что на след. Заседание ответчик приносит мировое соглашение на сумму выплаты, которую должны. Т.к.я живу в другом городе, судья сказал написать заявление, чтобы след. Заседание проводили без меня. Назначено оно было на февраль 2016. В начале марта я случайно узнала, что в иске мне отказано. Через знакомых в прокуратуре узнаю что причина отказа - ходатайство от ответчика о сроке исковой давности. Т.е.ответчик воспользовался случаем, что меня не будет на заседании и некому будет прокомментировать тот момент, что причину невыплаты денег я узнала только 9 сентября, а после передачи документов под роспись только 30 сентября я узнала о нарушении своих прав. В суд иск я подала 25 ноября. Как мне теперь быть? И как же проверки ТИ и прокуратурой, ведь нарушения выявлены!? Куда мне теперь обращаться? Я так понимаю решение в силу ещё не вступило, т.к. о результате заседания я узнавала через знакомых, на руки я ничего не получала, никаких уведомлений.