Если у ответчика ничего нет, ни долг не можем взыскать ни тем более пошлину.

Уточните, какая организационно-правовая форма Вашей организации и какая система налогообложения использует Ваша организация?

Если у Вас применяется УСН, то в соответствии с п. 1 ст. 346.17 Налогового кодекса Российской Федерации у налогоплательщиков, применяющих упрощенную систему налогообложения, датой получения доходов признается день поступления денежных средств на счета в банках и (или) в кассу, получения иного имущества (работ, услуг) и (или) имущественных прав, а также погашения задолженности (оплаты) налогоплательщику иным способом (кассовый метод).

Таким образом, налогоплательщик с учетом положений ст. 346.15 Кодекса должен включить в состав доходов, учитываемых при определении налоговой базы по налогу, уплачиваемому в связи с применением упрощенной системы налогообложения, суммы возвращенной госпошлины, присужденные судом, на день поступления денежных средств на счет в банке.

Мы Вас наверное неправильно поняли, если у Вас есть решение АС ,где прописано помимо всего прочего :"... взыскать с ответчика государственную пошлину", соответственно с ответчика ее взыскивать и надо.Другой вопрос, если у ответчика ничего нет - вот Вам и ответ, если имущества нет,денежных средств нет - что Вы возьмете? Решение АС неисполнимо, хотя оно и есть. Теперь ,на основании решения АС , Ваш бухгалтер , в случае неполучения задолженности на основании Решения АС и Исполнительного листа, сможет списать Дебиторскую задолженность на убытки.