В опеке узнали о моей судимости после многолетней опеки над внучкой - что делать?

Здравствуйте в данном случае вам бояться не стоит, все сроки, чтобы вам что то можно было предъявить вышли, если же будут оказывать давление, обратитесь с жалобой в прокуратуру на них.

Погашение судимости аннулирует все юридические последствия данной судимости, то есть юридически Вы чисты, но в Семейном кодексе есть такая статья

СК РФ Статья 146. Опекуны (попечители) детей

1. Опекунами (попечителями) детей могут назначаться только совершеннолетние дееспособные лица. Не могут быть назначены опекунами (попечителями):

лица, имеющие или имевшие судимость, подвергающиеся или подвергавшиеся уголовному преследованию (за исключением лиц, уголовное преследование в отношении которых прекращено по реабилитирующим основаниям) за преступления против жизни и здоровья, свободы, чести и достоинства личности (за исключением незаконного помещения в психиатрический стационар, клеветы и оскорбления), половой неприкосновенности и половой свободы личности, против семьи и несовершеннолетних, здоровья населения и общественной нравственности, а также против общественной безопасности, мира и безопасности человечества.

Вы имели судимость по ст. 119 УК РФ, она как раз относится к преступлениям против жизни и здоровья. Статья 116 УК РФ с того момента неоднократно изменялась и редакция 2006 года уже декриминализована, сейчас она звучит иначе чем в 2006 году, по этому ее рассматривать не будут. Но вот 119 будут. В статье Семейного кодекса написано не только имеющие, но и ИМЕВШИЕ судимость. Так что органы опеки правы.