Может ли ВУЗ устанавливать ЛНА, которые ухудшают положения Приказа Минобразования

Нет, вуз не вправе устанавливать локальные нормативные акты (ЛНА), которые ухудшают положения федерального законодательства, в том числе приказов Минобрнауки России.

В частности, если Приказ Минобрнауки России №303 прямо предусматривает возможность предоставления академического отпуска по семейным обстоятельствам, вуз не может своим ЛНА исключать это основание.

Согласно статье 30 Федерального закона от 29.12.2012 №273-ФЗ «Об образовании в Российской Федерации», образовательная организация принимает ЛНА в пределах своей компетенции в соответствии с законодательством РФ.

При этом нормы ЛНА, ухудшающие положение обучающихся по сравнению с установленным законодательством об образовании положением, не применяются и подлежат отмене образовательной организацией.

В Приказае Минобрнауки России от 04.04.2025 №303 «Об утверждении Порядка и оснований предоставления академического отпуска обучающимся» прямо указано, что академический отпуск может быть предоставлен, в том числе в иных исключительных случаях, в том числе в связи со стихийными бедствиями, по семейным обстоятельствам.

Конечно же это будет не законно и ВУЗ не имеет право

Нет, это незаконно, так как локальный нормативный акт вуза не может ограничивать права, прямо предоставленные федеральным нормативным правовым актом, в данном случае Приказом Минобрнауки.