Договор на передачу квартиры - можно ли убрать жену из приватизации через суд?

оснований для такого действия нет

Если на момент приватизации жена была зарегистрирована в квартире, то она приняла участие в приватизации (если не давала письменного отказа от участия в приватизации). Это означает, что она стала собственником доли в квартире.

Закон "О приватизации жилищного фонда в Российской Федерации"

Статья 2. Граждане Российской Федерации, имеющие право пользования жилыми помещениями государственного или муниципального жилищного фонда на условиях социального найма, вправе приобрести их на условиях, предусмотренных настоящим Законом, иными нормативными правовыми актами Российской Федерации и нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации, в общую собственность либо в собственность одного лица, в том числе несовершеннолетнего, с согласия всех имеющих право на приватизацию данных жилых помещений совершеннолетних лиц и несовершеннолетних в возрасте от 14 до 18 лет.

----------------------------------------------

Никого убрать из приватизации нельзя. Договор приватизации может быть признан недействительным при наличии оснований, предусмотренных законом, например, если сделка совершена в противоречии с требованиями закона. Но из вашего вопроса не следует, что такие основания имеются. К тому же для признания сделки недействительной существует срок исковой давности. В вашем случае он уже давно истек.

Поскольку жена была прописана на день приватизации, то исключить ее невозможно, даже в судебном порядке. Собственность была изначально совместная, теперь доли будут определены, все верно.