Проблемы с получением заработной платы и увольнением - что делать в данной ситуации?

Так не увольняются. Тем более руководители.

Закрыть нужно было больничный лист. Выйти на работу и написать заявление об увольнении, предупредив учредителя (собственника предприятия торговли) об этом за 14 дней. Затем издать приказ о проведении внеочередной инвентаризации (ревизии) по магазину в связи с увольнением руководителя и заняться этим с подведением итогов инвентаризации. В последний рабочий день расписаться в приказе об увольнении, получить трудовую книжку, передать документы организации и все ТМЦ по балансу ответственному лицу (новому руководителю или любому лицу, назначенному Вашим же приказом - например, заместителю директора или главному бухгалтеру).

Вы же озаботились только своим расчётом. И создали благоприятные условия для злоупотреблений со стороны бывшего работодателя: Вас и за прогулы могут уволить, и возложить на Вас мнимую недостачу ТМЦ. Всё это весьма возможно в дальнейшем.

Поэтому не в Ваших интересах сейчас "раздувать конфликт" с бывшим работодателем.

Я наоборот хотела предупридить заранее, потому что очень маленькая зарплата и не идут люди работать, чтоб начинали искать человека пока я на больничном. Я же нескрывалась, в письменной форме заявление не писала. Что как выйду с больничного мы все оформим и я подпишу все бумаги. Конфликт раздул сам работодатель. Он требует это сделать прям немедленно, я себя очень плохо чувствую, с финансами нужно сидеть разбираться, подготовить магазин к сдаче.