Наследство: квартира отца в аресте, каким документом оформить впоследствии право собственности на сына

Никак. Ждать смерти собственника .

Если желает может оформить завещание на сына.

Наследники унаследуют в том числе долги.

Сейчас - никак. После его смерти наследник унаследует имущество и долги наследодателя. После смерти наследники обращаются к нотариусу.

Снять - это наверное понимаете ситуации.

Можно ничего не делать - как сама жизнь распорядится. Можно просить собственника оформить завещание, которое он может отменить или изменить или оформить на другого человека в любое время. Ситуация распространённая. Имеется реальная возможность утраты квартиры.

Можно составить завещание стст 1118-1120 ГК РФ Но нужно вам понимать что вступление в наследство порождает обязанность ст 1175 ГК РФ по оплате долгов наследодателя - вашего бывшего мужа Долги ни как не снять - сыну вашему придется оплачивать их

Никак нее обезопасить. В случае его смерти сны примет по наследству и квартиру, и долги отца. Арест снимут после погашения долгов.

Если долг по алиментам перед сыном? Неужели сын его должен выплатить сам на себя???

Никак не оформите, только в наследственную массу войдёт, если до своей смерти не профукает квартиру.

Долг по алиментам солидарно будут платить наследники умершего в пределах стоимости принятого наследства как и другие долги и обязательтства, штрафы не связанные с личностью умершего.