В настоящее время компания почти не функционирует.

Закон не требует на это согласия других учредителей. Согласно ст. 26 Закона об ООО участник общества вправе в любое время выйти из общества независимо от согласия других его участников или общества. Подайте письменное заявление о выходе по почте заказным письмом с уведомлением о вручении или вручите под роспись на копии второму участнику. С момента вручения вашего заявления юридически вы считаетесь выбывшей из состава участников, ваша доля переходит к обществу, которое обязано вам выплатить действительную стоимость доли. Все переоформления учр. документов - это обязанность оставшегося участника и ген. директора.

Замечу, что действительная стоимость доли в ООО определяется действительной стоимостью его активов пропорционально доле участника. Поэтому для начала рекомендую истребовать бухгалтерский баланс и иные бухгалтерские документы Вашей организации с тем, чтобы знать, сколько Вам причитается доли (в натуре либо в стоимостном выражении). Если отказывают в ознакомлении - обращайтесь по этому поводу в арбитражный суд. Ознакомившись с бухгалтерскими документами и сделав необходимый расчет причитающейся Вам доли, посылайте уведомление о выходе из состава участников данного ООО, а затем - требование об уплате стоимости причитающейся Вам доли. При отказе либо неполучении ответа вопрос также решается в судебном порядке. Как видите, перспективы судебного решения Ваших проблем достаточно высоки. Удачи.